MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 101901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012943	CGA	2	6	201437	201442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797093
4502	NC_012943	CTA	2	6	201456	201461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797093
4503	NC_012943	CGC	2	6	201545	201550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797093
4504	NC_012943	CG	3	6	201567	201572	0 %	0 %	50 %	50 %	253797093
4505	NC_012943	CTG	2	6	201582	201587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797093
4506	NC_012943	AGC	2	6	201661	201666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797093
4507	NC_012943	AGG	2	6	201700	201705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797093
4508	NC_012943	CGT	2	6	201745	201750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797093
4509	NC_012943	TGC	2	6	201787	201792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797093
4510	NC_012943	AAG	2	6	201846	201851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797093
4511	NC_012943	GGA	2	6	201866	201871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797093
4512	NC_012943	GCC	3	9	201944	201952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797093
4513	NC_012943	ACC	2	6	201953	201958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797093
4514	NC_012943	CGG	2	6	201994	201999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797093
4515	NC_012943	GCC	2	6	202001	202006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797093
4516	NC_012943	CGG	2	6	202033	202038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797093
4517	NC_012943	CTCA	2	8	202080	202087	25 %	25 %	0 %	50 %	253797093
4518	NC_012943	CGC	2	6	202138	202143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797093
4519	NC_012943	CCGC	2	8	202161	202168	0 %	0 %	25 %	75 %	253797093
4520	NC_012943	GCC	2	6	202205	202210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797093
4521	NC_012943	AGG	2	6	202243	202248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797093
4522	NC_012943	C	6	6	202251	202256	0 %	0 %	0 %	100 %	253797093
4523	NC_012943	GCAC	2	8	202260	202267	25 %	0 %	25 %	50 %	253797093
4524	NC_012943	CGG	2	6	202306	202311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797093
4525	NC_012943	CAC	2	6	202327	202332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797093
4526	NC_012943	TCA	2	6	202363	202368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797093
4527	NC_012943	CGG	2	6	202373	202378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797093
4528	NC_012943	CGG	2	6	202382	202387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797093
4529	NC_012943	TGG	3	9	202488	202496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4530	NC_012943	GCTGGC	2	12	202498	202509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253797094
4531	NC_012943	TTG	2	6	202518	202523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797094
4532	NC_012943	AAC	2	6	202550	202555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797094
4533	NC_012943	GGT	2	6	202558	202563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4534	NC_012943	CGGT	2	8	202626	202633	0 %	25 %	50 %	25 %	253797094
4535	NC_012943	TCGA	2	8	202634	202641	25 %	25 %	25 %	25 %	253797094
4536	NC_012943	TGCC	2	8	202704	202711	0 %	25 %	25 %	50 %	253797094
4537	NC_012943	TGG	2	6	202743	202748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4538	NC_012943	GGT	2	6	202784	202789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4539	NC_012943	CGA	2	6	202882	202887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4540	NC_012943	AGC	2	6	202905	202910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4541	NC_012943	CTT	2	6	203038	203043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797094
4542	NC_012943	GGT	2	6	203047	203052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4543	NC_012943	GAC	2	6	203090	203095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4544	NC_012943	TCG	2	6	203103	203108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4545	NC_012943	CGT	2	6	203203	203208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4546	NC_012943	TTC	2	6	203216	203221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797094
4547	NC_012943	AAT	2	6	203255	203260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253797094
4548	NC_012943	ACC	2	6	203273	203278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797094
4549	NC_012943	TGC	2	6	203283	203288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4550	NC_012943	GGC	2	6	203341	203346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797094
4551	NC_012943	AC	3	6	203372	203377	50 %	0 %	0 %	50 %	253797094
4552	NC_012943	GTG	2	6	203384	203389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4553	NC_012943	ACT	2	6	203532	203537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797094
4554	NC_012943	GCC	2	6	203614	203619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797094
4555	NC_012943	GTG	2	6	203702	203707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4556	NC_012943	GGT	2	6	203786	203791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797094
4557	NC_012943	CGT	2	6	203808	203813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4558	NC_012943	CCCG	2	8	203827	203834	0 %	0 %	25 %	75 %	253797094
4559	NC_012943	ACG	2	6	203850	203855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4560	NC_012943	TGC	2	6	203865	203870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797094
4561	NC_012943	ACC	2	6	203905	203910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797094
4562	NC_012943	GCC	2	6	203911	203916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797094
4563	NC_012943	AGG	2	6	203992	203997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797094
4564	NC_012943	ATG	2	6	204004	204009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797094
4565	NC_012943	CGG	2	6	204129	204134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797095
4566	NC_012943	TGG	2	6	204215	204220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797095
4567	NC_012943	GATC	2	8	204236	204243	25 %	25 %	25 %	25 %	253797095
4568	NC_012943	CG	3	6	204244	204249	0 %	0 %	50 %	50 %	253797095
4569	NC_012943	GAA	2	6	204258	204263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797095
4570	NC_012943	ACGCTG	2	12	204274	204285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253797095
4571	NC_012943	GAA	2	6	204291	204296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797095
4572	NC_012943	CTG	2	6	204346	204351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797095
4573	NC_012943	GCA	2	6	204357	204362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797095
4574	NC_012943	GCCGC	2	10	204373	204382	0 %	0 %	40 %	60 %	253797095
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4579	NC_012943	GCGG	2	8	204552	204559	0 %	0 %	75 %	25 %	253797095
4580	NC_012943	CGA	2	6	204600	204605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797095
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4582	NC_012943	GTT	2	6	204657	204662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797095
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4585	NC_012943	GACCT	2	10	204991	205000	20 %	20 %	20 %	40 %	253797095
4586	NC_012943	GC	3	6	205053	205058	0 %	0 %	50 %	50 %	253797095
4587	NC_012943	AC	3	6	205112	205117	50 %	0 %	0 %	50 %	253797095
4588	NC_012943	GGC	2	6	205138	205143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797095
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4591	NC_012943	TGG	2	6	205270	205275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797096
4592	NC_012943	TCC	2	6	205533	205538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797096
4593	NC_012943	TGC	2	6	205639	205644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797096
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4595	NC_012943	GGTG	2	8	205664	205671	0 %	25 %	75 %	0 %	253797096
4596	NC_012943	TCG	2	6	205717	205722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797096
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4599	NC_012943	GGC	2	6	205895	205900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797096
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4601	NC_012943	TTG	2	6	206022	206027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797096
4602	NC_012943	TCC	2	6	206032	206037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797096
4603	NC_012943	TGC	2	6	206084	206089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797096
4604	NC_012943	CCG	3	9	206121	206129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797096
4605	NC_012943	TTC	2	6	206143	206148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797096
4606	NC_012943	G	6	6	206245	206250	0 %	0 %	100 %	0 %	253797096
4607	NC_012943	GCG	2	6	206289	206294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797096
4608	NC_012943	GC	3	6	206394	206399	0 %	0 %	50 %	50 %	253797096
4609	NC_012943	CCG	2	6	206470	206475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797096
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4611	NC_012943	GCA	2	6	206552	206557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797096
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4983	NC_012943	GC	3	6	222830	222835	0 %	0 %	50 %	50 %	253797113
4984	NC_012943	CAC	2	6	222870	222875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797113
4985	NC_012943	GAT	2	6	222911	222916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797113
4986	NC_012943	CCTACA	2	12	222940	222951	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	253797113
4987	NC_012943	GTG	2	6	222954	222959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797113
4988	NC_012943	ATC	2	6	222960	222965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797113
4989	NC_012943	CGT	2	6	222971	222976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797113
4990	NC_012943	CTGGC	2	10	222996	223005	0 %	20 %	40 %	40 %	253797113
4991	NC_012943	CGC	2	6	223010	223015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797113
4992	NC_012943	TGG	2	6	223048	223053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797113
4993	NC_012943	TCG	2	6	223090	223095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797113
4994	NC_012943	CGG	2	6	223111	223116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797113
4995	NC_012943	CTG	2	6	223173	223178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797113
4996	NC_012943	TGC	2	6	223231	223236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797113
4997	NC_012943	CGG	2	6	223240	223245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797113
4998	NC_012943	GCG	3	9	223255	223263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797113
4999	NC_012943	CAT	2	6	223313	223318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797113
5000	NC_012943	CTG	2	6	223329	223334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797113

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